Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms