Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trim44Q9QXA7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trim44Q9QXA7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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