Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ybx3Q9JKB3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms