Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cmtm7Q9ESD6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cmtm7Q9ESD6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms