Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TnmdQ9EP64 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TnmdQ9EP64 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TnmdQ9EP64 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TnmdQ9EP64 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TnmdQ9EP64 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TnmdQ9EP64 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TnmdQ9EP64 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TnmdQ9EP64 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TnmdQ9EP64 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TnmdQ9EP64 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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TnmdQ9EP64 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TnmdQ9EP64 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnmdQ9EP64 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms