Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Xab2Q9DCD2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms