Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Smg9Q9DB90 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Smg9Q9DB90 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Smg9Q9DB90 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Smg9Q9DB90 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Smg9Q9DB90 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Smg9Q9DB90 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Smg9Q9DB90 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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