Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms