Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms