Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms