Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzd9Q9D9M4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzd9Q9D9M4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzd9Q9D9M4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzd9Q9D9M4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzd9Q9D9M4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Pdzd9Q9D9M4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Pdzd9Q9D9M4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Pdzd9Q9D9M4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Pdzd9Q9D9M4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd9Q9D9M4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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