Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms