Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgm5Q9D7I9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgm5Q9D7I9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms