Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Cldn23Q9D7D7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn23Q9D7D7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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