Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms