Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms