Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf6Q9D4J7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf6Q9D4J7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phf6Q9D4J7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Phf6Q9D4J7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Phf6Q9D4J7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Phf6Q9D4J7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Phf6Q9D4J7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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