Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fndc8Q9D2H8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms