Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tmem88Q9D0N8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tmem88Q9D0N8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tmem88Q9D0N8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tmem88Q9D0N8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tmem88Q9D0N8 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Tmem88Q9D0N8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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