Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Rfc5Q9D0F6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Rfc5Q9D0F6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rfc5Q9D0F6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rfc5Q9D0F6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms