Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CYI0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms