Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RpainQ9CWY9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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