Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms