Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tdrd12Q9CWU0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms