Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pard3bQ9CSB4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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