Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms