Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PompQ9CQT5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms