Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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