Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms