Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms