Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Brms1Q99N20 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Brms1Q99N20 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms