Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ms4a4dQ99N05 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ms4a4dQ99N05 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms