Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms