Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rab28Q99KL7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rab28Q99KL7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rab28Q99KL7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rab28Q99KL7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rab28Q99KL7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rab28Q99KL7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rab28Q99KL7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rab28Q99KL7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rab28Q99KL7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rab28Q99KL7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rab28Q99KL7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rab28Q99KL7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rab28Q99KL7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rab28Q99KL7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab28Q99KL7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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