Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmed9Q99KF1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms