Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlgn1Q99K10 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms