Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TrabdQ99JY4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms