Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc30a1Q99J38 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms