Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PdgfdQ925I7 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PdgfdQ925I7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PdgfdQ925I7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PdgfdQ925I7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PdgfdQ925I7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PdgfdQ925I7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PdgfdQ925I7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PdgfdQ925I7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PdgfdQ925I7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PdgfdQ925I7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms