Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gtpbp3Q923K4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gtpbp3Q923K4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gtpbp3Q923K4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gtpbp3Q923K4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gtpbp3Q923K4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gtpbp3Q923K4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gtpbp3Q923K4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtpbp3Q923K4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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