Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms