Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms