Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms