Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf39Q8K2Z2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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