Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcho1Q8K285 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms