Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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