Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms