Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Znf628Q8CJ78 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Znf628Q8CJ78 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Znf628Q8CJ78 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf628Q8CJ78 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms