Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms