Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc178Q8CDV0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms